Встречается такой эффект, давно как-то разбирались .. не знаю верны-ли были сделаны выводы ..
В DC СО2 излучателях излучение поляризованное, и при фокусировки получается овал, что и даёт разную ширину реза в перпендикулярных осях. Попробуйте провернуть излучатель на 45% в любую сторону.